水解池主要作用是水解酸化，属于厌氧反应。水解和酸化是两个过程，水解在厌氧、缺氧和好养阶段都能发生，酸化则是典型的发酵过程，在厌氧条件下，这两个过程是不能分开的。水解酸化池中只是发生了厌氧消化中的前两个阶段，它的最终产物是低浓度的有机酸。这样，它的作用主要是加强污水的可生化性。由于在水解酸化池的污水中没有大量的硝态氮，即使是DO升至0.5mg/l，它也不可能发生反硝化。而缺氧池的作用，主要是作用为反硝化，脱氮除磷。及在A-A-O系统中，部分BOD都是在这单元除去的。
由于设计参数不同水解酸化池是控制停留时间，主要是厌氧反应的第一、第二阶段。缺氧持是控制DO、回流比，主要是兼氧、厌氧反映。根据二者工艺参数的控制、作用均不相同。
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